Producen impactos ambientales irreversibles, debido al anegamiento de amplísimas zonas que pueden contener pueblos enteros.

Algunas presas presentan fallos o errores de construcción.

Ante grandes avalanchas de agua pueden derrumbarse anegando amplias zonas agrícolas como ocurrió con el pantano de Tous (Valencia) en 1981.

Su potencia eléctrica depende de los Hm³ de agua embalsada debida fundamentalmente a las lluvias y al deshielo. Puede haber temporadas de mucha sequía con el correspondiente descenso en el nivel de los pantanos y de la potencia eléctrica disponible.

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